Protein–RNA interactions for Protein: P35542

SAA4, Serum amyloid A-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA4P35542 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAA4P35542 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAA4P35542 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAA4P35542 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAA4P35542 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAA4P35542 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAA4P35542 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SAA4P35542 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAA4P35542 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAA4P35542 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAA4P35542 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAA4P35542 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAA4P35542 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SAA4P35542 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAA4P35542 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAA4P35542 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAA4P35542 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAA4P35542 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAA4P35542 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAA4P35542 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAA4P35542 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAA4P35542 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAA4P35542 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAA4P35542 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAA4P35542 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAA4P35542 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAA4P35542 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAA4P35542 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAA4P35542 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAA4P35542 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAA4P35542 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAA4P35542 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAA4P35542 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAA4P35542 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAA4P35542 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAA4P35542 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAA4P35542 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAA4P35542 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAA4P35542 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAA4P35542 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAA4P35542 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAA4P35542 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAA4P35542 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAA4P35542 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SAA4P35542 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAA4P35542 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAA4P35542 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAA4P35542 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAA4P35542 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAA4P35542 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAA4P35542 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAA4P35542 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAA4P35542 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SAA4P35542 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAA4P35542 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAA4P35542 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAA4P35542 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAA4P35542 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAA4P35542 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAA4P35542 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAA4P35542 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAA4P35542 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAA4P35542 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAA4P35542 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAA4P35542 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAA4P35542 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAA4P35542 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAA4P35542 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAA4P35542 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAA4P35542 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAA4P35542 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAA4P35542 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAA4P35542 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAA4P35542 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAA4P35542 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAA4P35542 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAA4P35542 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAA4P35542 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAA4P35542 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAA4P35542 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SAA4P35542 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAA4P35542 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAA4P35542 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAA4P35542 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAA4P35542 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAA4P35542 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAA4P35542 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAA4P35542 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAA4P35542 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAA4P35542 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAA4P35542 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAA4P35542 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAA4P35542 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAA4P35542 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAA4P35542 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAA4P35542 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAA4P35542 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAA4P35542 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAA4P35542 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAA4P35542 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms