Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGB7P26010 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGB7P26010 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGB7P26010 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB7P26010 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGB7P26010 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGB7P26010 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGB7P26010 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB7P26010 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGB7P26010 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGB7P26010 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITGB7P26010 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB7P26010 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGB7P26010 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGB7P26010 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGB7P26010 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB7P26010 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGB7P26010 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ITGB7P26010 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ITGB7P26010 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGB7P26010 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITGB7P26010 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGB7P26010 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGB7P26010 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGB7P26010 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB7P26010 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB7P26010 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB7P26010 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB7P26010 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB7P26010 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB7P26010 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB7P26010 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB7P26010 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGB7P26010 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB7P26010 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB7P26010 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB7P26010 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGB7P26010 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB7P26010 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB7P26010 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB7P26010 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB7P26010 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB7P26010 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB7P26010 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB7P26010 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB7P26010 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB7P26010 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB7P26010 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB7P26010 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB7P26010 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB7P26010 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGB7P26010 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB7P26010 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB7P26010 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB7P26010 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB7P26010 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB7P26010 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB7P26010 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB7P26010 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB7P26010 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB7P26010 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGB7P26010 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB7P26010 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB7P26010 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB7P26010 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB7P26010 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB7P26010 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB7P26010 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB7P26010 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB7P26010 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB7P26010 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB7P26010 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB7P26010 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB7P26010 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB7P26010 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB7P26010 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB7P26010 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGB7P26010 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB7P26010 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB7P26010 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB7P26010 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB7P26010 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB7P26010 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB7P26010 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB7P26010 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB7P26010 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB7P26010 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms