Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TCF3P15923 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TCF3P15923 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TCF3P15923 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TCF3P15923 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TCF3P15923 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TCF3P15923 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TCF3P15923 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TCF3P15923 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TCF3P15923 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TCF3P15923 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TCF3P15923 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TCF3P15923 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TCF3P15923 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TCF3P15923 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TCF3P15923 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TCF3P15923 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TCF3P15923 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TCF3P15923 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TCF3P15923 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TCF3P15923 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TCF3P15923 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TCF3P15923 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TCF3P15923 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TCF3P15923 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TCF3P15923 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TCF3P15923 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TCF3P15923 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TCF3P15923 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TCF3P15923 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCF3P15923 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCF3P15923 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCF3P15923 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TCF3P15923 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TCF3P15923 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCF3P15923 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCF3P15923 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCF3P15923 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TCF3P15923 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TCF3P15923 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TCF3P15923 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TCF3P15923 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TCF3P15923 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TCF3P15923 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TCF3P15923 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TCF3P15923 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TCF3P15923 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TCF3P15923 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TCF3P15923 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TCF3P15923 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TCF3P15923 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TCF3P15923 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TCF3P15923 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TCF3P15923 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TCF3P15923 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TCF3P15923 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TCF3P15923 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TCF3P15923 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TCF3P15923 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TCF3P15923 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TCF3P15923 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCF3P15923 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCF3P15923 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TCF3P15923 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCF3P15923 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCF3P15923 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCF3P15923 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCF3P15923 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCF3P15923 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCF3P15923 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCF3P15923 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCF3P15923 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TCF3P15923 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TCF3P15923 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCF3P15923 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCF3P15923 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCF3P15923 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCF3P15923 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCF3P15923 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TCF3P15923 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TCF3P15923 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TCF3P15923 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TCF3P15923 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCF3P15923 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCF3P15923 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCF3P15923 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCF3P15923 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TCF3P15923 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TCF3P15923 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCF3P15923 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TCF3P15923 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCF3P15923 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCF3P15923 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TCF3P15923 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TCF3P15923 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCF3P15923 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCF3P15923 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TCF3P15923 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TCF3P15923 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TCF3P15923 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms