Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATF2P15336 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATF2P15336 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATF2P15336 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATF2P15336 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF2P15336 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATF2P15336 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATF2P15336 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ATF2P15336 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATF2P15336 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF2P15336 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF2P15336 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF2P15336 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF2P15336 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF2P15336 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATF2P15336 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF2P15336 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATF2P15336 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF2P15336 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATF2P15336 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATF2P15336 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATF2P15336 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATF2P15336 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATF2P15336 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF2P15336 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF2P15336 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF2P15336 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF2P15336 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF2P15336 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF2P15336 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATF2P15336 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF2P15336 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF2P15336 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF2P15336 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF2P15336 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF2P15336 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATF2P15336 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATF2P15336 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATF2P15336 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATF2P15336 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATF2P15336 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATF2P15336 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATF2P15336 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATF2P15336 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ATF2P15336 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ATF2P15336 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ATF2P15336 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF2P15336 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATF2P15336 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATF2P15336 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATF2P15336 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATF2P15336 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ATF2P15336 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATF2P15336 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATF2P15336 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATF2P15336 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATF2P15336 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATF2P15336 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF2P15336 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATF2P15336 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF2P15336 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF2P15336 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF2P15336 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF2P15336 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF2P15336 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATF2P15336 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATF2P15336 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATF2P15336 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATF2P15336 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATF2P15336 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ATF2P15336 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATF2P15336 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ATF2P15336 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATF2P15336 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATF2P15336 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATF2P15336 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ATF2P15336 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATF2P15336 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATF2P15336 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATF2P15336 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATF2P15336 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATF2P15336 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATF2P15336 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATF2P15336 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATF2P15336 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATF2P15336 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATF2P15336 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATF2P15336 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATF2P15336 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATF2P15336 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATF2P15336 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATF2P15336 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATF2P15336 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATF2P15336 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATF2P15336 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATF2P15336 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF2P15336 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF2P15336 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF2P15336 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF2P15336 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms