Protein–RNA interactions for Protein: P10124

SRGN, Serglycin, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGNP10124 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SRGNP10124 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SRGNP10124 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SRGNP10124 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SRGNP10124 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SRGNP10124 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SRGNP10124 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SRGNP10124 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SRGNP10124 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SRGNP10124 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SRGNP10124 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SRGNP10124 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SRGNP10124 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SRGNP10124 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SRGNP10124 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SRGNP10124 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SRGNP10124 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SRGNP10124 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SRGNP10124 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SRGNP10124 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SRGNP10124 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SRGNP10124 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SRGNP10124 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SRGNP10124 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SRGNP10124 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SRGNP10124 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SRGNP10124 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SRGNP10124 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SRGNP10124 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SRGNP10124 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SRGNP10124 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SRGNP10124 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SRGNP10124 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SRGNP10124 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
SRGNP10124 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SRGNP10124 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
SRGNP10124 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SRGNP10124 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SRGNP10124 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SRGNP10124 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SRGNP10124 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SRGNP10124 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SRGNP10124 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SRGNP10124 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SRGNP10124 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SRGNP10124 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
SRGNP10124 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SRGNP10124 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SRGNP10124 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SRGNP10124 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SRGNP10124 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SRGNP10124 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SRGNP10124 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SRGNP10124 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SRGNP10124 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SRGNP10124 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SRGNP10124 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SRGNP10124 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SRGNP10124 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SRGNP10124 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SRGNP10124 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SRGNP10124 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SRGNP10124 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SRGNP10124 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SRGNP10124 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SRGNP10124 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SRGNP10124 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SRGNP10124 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SRGNP10124 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SRGNP10124 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SRGNP10124 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SRGNP10124 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SRGNP10124 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SRGNP10124 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SRGNP10124 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SRGNP10124 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SRGNP10124 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SRGNP10124 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SRGNP10124 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SRGNP10124 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SRGNP10124 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SRGNP10124 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SRGNP10124 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SRGNP10124 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SRGNP10124 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SRGNP10124 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SRGNP10124 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SRGNP10124 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SRGNP10124 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SRGNP10124 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SRGNP10124 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SRGNP10124 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SRGNP10124 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SRGNP10124 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SRGNP10124 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SRGNP10124 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SRGNP10124 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SRGNP10124 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SRGNP10124 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SRGNP10124 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms