Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
C4AP0C0L4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
C4AP0C0L4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
C4AP0C0L4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
C4AP0C0L4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
C4AP0C0L4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
C4AP0C0L4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
C4AP0C0L4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
C4AP0C0L4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
C4AP0C0L4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
C4AP0C0L4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
C4AP0C0L4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
C4AP0C0L4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
C4AP0C0L4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
C4AP0C0L4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
C4AP0C0L4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
C4AP0C0L4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
C4AP0C0L4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
C4AP0C0L4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
C4AP0C0L4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
C4AP0C0L4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
C4AP0C0L4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
C4AP0C0L4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
C4AP0C0L4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
C4AP0C0L4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
C4AP0C0L4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
C4AP0C0L4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
C4AP0C0L4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
C4AP0C0L4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
C4AP0C0L4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
C4AP0C0L4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
C4AP0C0L4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
C4AP0C0L4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.06■■■■■ 4
C4AP0C0L4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
C4AP0C0L4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.01■■■■■ 4
C4AP0C0L4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
C4AP0C0L4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
C4AP0C0L4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
C4AP0C0L4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
C4AP0C0L4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
C4AP0C0L4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
C4AP0C0L4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
C4AP0C0L4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C4AP0C0L4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
C4AP0C0L4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
C4AP0C0L4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
C4AP0C0L4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
C4AP0C0L4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
C4AP0C0L4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
C4AP0C0L4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
C4AP0C0L4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
C4AP0C0L4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
C4AP0C0L4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
C4AP0C0L4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
C4AP0C0L4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
C4AP0C0L4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
C4AP0C0L4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
C4AP0C0L4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
C4AP0C0L4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
C4AP0C0L4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
C4AP0C0L4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
C4AP0C0L4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
C4AP0C0L4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
C4AP0C0L4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
C4AP0C0L4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
C4AP0C0L4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
C4AP0C0L4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
C4AP0C0L4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
C4AP0C0L4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
C4AP0C0L4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
C4AP0C0L4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
C4AP0C0L4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
C4AP0C0L4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
C4AP0C0L4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
C4AP0C0L4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
C4AP0C0L4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
C4AP0C0L4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
C4AP0C0L4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
C4AP0C0L4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
C4AP0C0L4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
C4AP0C0L4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
C4AP0C0L4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
C4AP0C0L4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
C4AP0C0L4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
C4AP0C0L4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C4AP0C0L4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
C4AP0C0L4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
C4AP0C0L4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
C4AP0C0L4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms