Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.71■■■■■ 5.07
LTN1O94822 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
LTN1O94822 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
LTN1O94822 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
LTN1O94822 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
LTN1O94822 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
LTN1O94822 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
LTN1O94822 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
LTN1O94822 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
LTN1O94822 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
LTN1O94822 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
LTN1O94822 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
LTN1O94822 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
LTN1O94822 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
LTN1O94822 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
LTN1O94822 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
LTN1O94822 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
LTN1O94822 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
LTN1O94822 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
LTN1O94822 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LTN1O94822 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
LTN1O94822 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
LTN1O94822 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
LTN1O94822 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
LTN1O94822 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
LTN1O94822 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
LTN1O94822 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
LTN1O94822 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
LTN1O94822 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
LTN1O94822 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
LTN1O94822 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
LTN1O94822 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
LTN1O94822 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
LTN1O94822 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
LTN1O94822 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
LTN1O94822 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
LTN1O94822 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
LTN1O94822 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
LTN1O94822 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
LTN1O94822 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LTN1O94822 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LTN1O94822 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
LTN1O94822 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
LTN1O94822 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
LTN1O94822 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
LTN1O94822 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LTN1O94822 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LTN1O94822 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
LTN1O94822 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
LTN1O94822 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41■■■■■ 4.15
LTN1O94822 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
LTN1O94822 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
LTN1O94822 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LTN1O94822 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LTN1O94822 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LTN1O94822 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
LTN1O94822 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
LTN1O94822 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LTN1O94822 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LTN1O94822 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LTN1O94822 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LTN1O94822 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
LTN1O94822 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LTN1O94822 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LTN1O94822 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
LTN1O94822 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
LTN1O94822 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
LTN1O94822 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LTN1O94822 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LTN1O94822 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LTN1O94822 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LTN1O94822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
LTN1O94822 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LTN1O94822 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
LTN1O94822 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
LTN1O94822 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
LTN1O94822 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
LTN1O94822 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
LTN1O94822 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LTN1O94822 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
LTN1O94822 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
LTN1O94822 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LTN1O94822 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
LTN1O94822 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LTN1O94822 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LTN1O94822 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
LTN1O94822 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
LTN1O94822 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
LTN1O94822 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LTN1O94822 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LTN1O94822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms