Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TULP3O75386 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TULP3O75386 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TULP3O75386 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TULP3O75386 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TULP3O75386 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TULP3O75386 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TULP3O75386 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP3O75386 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP3O75386 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TULP3O75386 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP3O75386 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP3O75386 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP3O75386 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TULP3O75386 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TULP3O75386 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TULP3O75386 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP3O75386 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP3O75386 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TULP3O75386 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TULP3O75386 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP3O75386 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP3O75386 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TULP3O75386 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP3O75386 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP3O75386 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TULP3O75386 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP3O75386 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TULP3O75386 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TULP3O75386 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TULP3O75386 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TULP3O75386 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TULP3O75386 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TULP3O75386 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TULP3O75386 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TULP3O75386 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TULP3O75386 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TULP3O75386 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TULP3O75386 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TULP3O75386 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TULP3O75386 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TULP3O75386 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TULP3O75386 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TULP3O75386 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TULP3O75386 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TULP3O75386 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TULP3O75386 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TULP3O75386 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TULP3O75386 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TULP3O75386 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TULP3O75386 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TULP3O75386 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TULP3O75386 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TULP3O75386 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TULP3O75386 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TULP3O75386 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TULP3O75386 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TULP3O75386 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TULP3O75386 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TULP3O75386 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TULP3O75386 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TULP3O75386 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TULP3O75386 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TULP3O75386 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TULP3O75386 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TULP3O75386 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TULP3O75386 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TULP3O75386 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TULP3O75386 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TULP3O75386 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TULP3O75386 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TULP3O75386 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TULP3O75386 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TULP3O75386 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TULP3O75386 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TULP3O75386 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TULP3O75386 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TULP3O75386 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TULP3O75386 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TULP3O75386 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TULP3O75386 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TULP3O75386 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TULP3O75386 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TULP3O75386 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP3O75386 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP3O75386 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP3O75386 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP3O75386 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TULP3O75386 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TULP3O75386 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TULP3O75386 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TULP3O75386 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TULP3O75386 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TULP3O75386 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TULP3O75386 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TULP3O75386 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TULP3O75386 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TULP3O75386 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP3O75386 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP3O75386 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms