Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATG13O75143 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATG13O75143 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATG13O75143 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATG13O75143 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATG13O75143 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATG13O75143 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATG13O75143 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ATG13O75143 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATG13O75143 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG13O75143 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATG13O75143 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG13O75143 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG13O75143 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATG13O75143 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG13O75143 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG13O75143 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG13O75143 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATG13O75143 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG13O75143 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATG13O75143 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATG13O75143 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG13O75143 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG13O75143 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG13O75143 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG13O75143 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG13O75143 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG13O75143 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATG13O75143 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATG13O75143 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATG13O75143 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATG13O75143 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG13O75143 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG13O75143 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ATG13O75143 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ATG13O75143 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATG13O75143 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATG13O75143 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATG13O75143 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG13O75143 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG13O75143 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG13O75143 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG13O75143 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATG13O75143 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATG13O75143 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATG13O75143 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATG13O75143 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG13O75143 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ATG13O75143 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATG13O75143 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATG13O75143 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATG13O75143 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATG13O75143 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATG13O75143 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG13O75143 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG13O75143 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG13O75143 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG13O75143 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG13O75143 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG13O75143 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG13O75143 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG13O75143 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG13O75143 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG13O75143 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG13O75143 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATG13O75143 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG13O75143 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG13O75143 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG13O75143 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG13O75143 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATG13O75143 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATG13O75143 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATG13O75143 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG13O75143 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG13O75143 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATG13O75143 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATG13O75143 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG13O75143 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATG13O75143 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATG13O75143 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG13O75143 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG13O75143 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATG13O75143 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG13O75143 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG13O75143 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG13O75143 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG13O75143 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG13O75143 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG13O75143 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG13O75143 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG13O75143 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG13O75143 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG13O75143 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG13O75143 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG13O75143 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG13O75143 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG13O75143 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATG13O75143 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATG13O75143 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATG13O75143 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms