Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ABCC4O15439 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCC4O15439 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC4O15439 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC4O15439 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC4O15439 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC4O15439 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC4O15439 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC4O15439 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC4O15439 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCC4O15439 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC4O15439 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCC4O15439 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ABCC4O15439 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC4O15439 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC4O15439 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC4O15439 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC4O15439 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC4O15439 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC4O15439 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC4O15439 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC4O15439 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ABCC4O15439 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ABCC4O15439 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ABCC4O15439 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
ABCC4O15439 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ABCC4O15439 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ABCC4O15439 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ABCC4O15439 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ABCC4O15439 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCC4O15439 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ABCC4O15439 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ABCC4O15439 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ABCC4O15439 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ABCC4O15439 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ABCC4O15439 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ABCC4O15439 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ABCC4O15439 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC4O15439 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC4O15439 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC4O15439 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC4O15439 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC4O15439 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ABCC4O15439 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ABCC4O15439 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ABCC4O15439 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ABCC4O15439 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC4O15439 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ABCC4O15439 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ABCC4O15439 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ABCC4O15439 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC4O15439 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC4O15439 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC4O15439 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC4O15439 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC4O15439 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC4O15439 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC4O15439 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC4O15439 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC4O15439 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC4O15439 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC4O15439 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC4O15439 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
ABCC4O15439 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC4O15439 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
ABCC4O15439 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC4O15439 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ABCC4O15439 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ABCC4O15439 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ABCC4O15439 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC4O15439 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC4O15439 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC4O15439 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC4O15439 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC4O15439 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC4O15439 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC4O15439 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC4O15439 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC4O15439 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC4O15439 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ABCC4O15439 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ABCC4O15439 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ABCC4O15439 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ABCC4O15439 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC4O15439 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC4O15439 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC4O15439 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC4O15439 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC4O15439 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC4O15439 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC4O15439 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC4O15439 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC4O15439 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC4O15439 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCC4O15439 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms