Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL1

ST20-MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.37■■■■■ 5.33
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.89
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.26
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms