Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SNX13Q9Y5W8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX13Q9Y5W8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX13Q9Y5W8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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