Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX15Q9NRS6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms