Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGALS3BPQ08380 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms