RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606507.1

RPL23AP53-202, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 53, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RPL23AP53, Length 370 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP53-202ENST00000606507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.64■■■■■ 5.22
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RPL23AP53-202ENST00000606507 NACADO15069 1562 aa39.86■■■■□ 3.97
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RPL23AP53-202ENST00000606507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39■■■■□ 3.83
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RPL23AP53-202ENST00000606507 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.7■■■■□ 3.79
RPL23AP53-202ENST00000606507 SCRIBQ14160 1630 aa38.58■■■■□ 3.77
RPL23AP53-202ENST00000606507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.3■■■■□ 3.72
RPL23AP53-202ENST00000606507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.13■■■■□ 3.69
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RPL23AP53-202ENST00000606507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.51■■■■□ 3.6
RPL23AP53-202ENST00000606507 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.26■■■■□ 3.55
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RPL23AP53-202ENST00000606507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
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RPL23AP53-202ENST00000606507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.78■■■■□ 3.48
RPL23AP53-202ENST00000606507 SMARCA2P51531 1590 aa36.73■■■■□ 3.47
RPL23AP53-202ENST00000606507 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.7■■■■□ 3.46
RPL23AP53-202ENST00000606507 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.64■■■■□ 3.46
RPL23AP53-202ENST00000606507 HMGXB3Q12766 1538 aa36.58■■■■□ 3.45
RPL23AP53-202ENST00000606507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
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RPL23AP53-202ENST00000606507 NESP48681 1621 aa35.86■■■■□ 3.33
RPL23AP53-202ENST00000606507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.81■■■■□ 3.32
RPL23AP53-202ENST00000606507 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.71■■■■□ 3.31
RPL23AP53-202ENST00000606507 ERCC6Q03468 1493 aa35.7■■■■□ 3.31
RPL23AP53-202ENST00000606507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.57■■■■□ 3.28
RPL23AP53-202ENST00000606507 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.5■■■■□ 3.27
RPL23AP53-202ENST00000606507 CFTRP13569 1480 aa35.48■■■■□ 3.27
RPL23AP53-202ENST00000606507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.43■■■■□ 3.26
RPL23AP53-202ENST00000606507 CUX2O14529 1486 aa35.41■■■■□ 3.26
RPL23AP53-202ENST00000606507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
RPL23AP53-202ENST00000606507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
RPL23AP53-202ENST00000606507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.26■■■■□ 3.23
RPL23AP53-202ENST00000606507 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.22■■■■□ 3.23
RPL23AP53-202ENST00000606507 PRDM2Q13029 1718 aa35.2■■■■□ 3.23
RPL23AP53-202ENST00000606507 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.17■■■■□ 3.22
RPL23AP53-202ENST00000606507 WDR62O43379 1518 aa35.07■■■■□ 3.21
RPL23AP53-202ENST00000606507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
RPL23AP53-202ENST00000606507 ABCC8Q09428 1581 aa34.75■■■■□ 3.15
RPL23AP53-202ENST00000606507 TOPBP1Q92547 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
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RPL23AP53-202ENST00000606507 IFT140Q96RY7 1462 aa34.5■■■■□ 3.11
RPL23AP53-202ENST00000606507 CUX1P39880 1505 aa34.42■■■■□ 3.1
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RPL23AP53-202ENST00000606507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
RPL23AP53-202ENST00000606507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.31■■■■□ 3.08
RPL23AP53-202ENST00000606507 SOGA1O94964 1423 aa34.28■■■■□ 3.08
RPL23AP53-202ENST00000606507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.24■■■■□ 3.07
RPL23AP53-202ENST00000606507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
RPL23AP53-202ENST00000606507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
RPL23AP53-202ENST00000606507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.14■■■■□ 3.06
RPL23AP53-202ENST00000606507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
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RPL23AP53-202ENST00000606507 WDR97A6NE52 1622 aa34.09■■■■□ 3.05
RPL23AP53-202ENST00000606507 SYNJ1O43426 1573 aa34.08■■■■□ 3.05
RPL23AP53-202ENST00000606507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
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RPL23AP53-202ENST00000606507 GRIN2BQ13224 1484 aa33.88■■■■□ 3.01
RPL23AP53-202ENST00000606507 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.87■■■■□ 3.01
RPL23AP53-202ENST00000606507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.85■■■■□ 3.01
RPL23AP53-202ENST00000606507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.8■■■■□ 3
RPL23AP53-202ENST00000606507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
RPL23AP53-202ENST00000606507 PBRM1Q86U86 1689 aa33.78■■■■□ 3
RPL23AP53-202ENST00000606507 CHD1O14646 1710 aa33.76■■■■□ 3
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RPL23AP53-202ENST00000606507 KIF27Q86VH2 1401 aa33.49■■■□□ 2.95
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RPL23AP53-202ENST00000606507 TRIM41Q8WV44 630 aa33.36■■■□□ 2.93
RPL23AP53-202ENST00000606507 ARHGEF11O15085 1522 aa33.35■■■□□ 2.93
RPL23AP53-202ENST00000606507 NUP160Q12769 1436 aa33.3■■■□□ 2.92
RPL23AP53-202ENST00000606507 CUL7Q14999 1698 aa33.26■■■□□ 2.92
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RPL23AP53-202ENST00000606507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.17■■■□□ 2.9
RPL23AP53-202ENST00000606507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.17■■■□□ 2.9
RPL23AP53-202ENST00000606507 ARAP1Q96P48 1450 aa33.08■■■□□ 2.89
RPL23AP53-202ENST00000606507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.06■■■□□ 2.88
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RPL23AP53-202ENST00000606507 JPH4Q96JJ6 628 aa32.99■■■□□ 2.87
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