Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXNB1O43157 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms