Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MKLN1Q9UL63 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms