Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSEN1P49768 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms