Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.638e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-213ENST00000524288 732 ntTSL 1 (best)3.85□□□□□ -1.798e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.888e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.918e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -28e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 52.25□□□□□ -2.058e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 32.25□□□□□ -2.058e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 31.14□□□□□ -2.238e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PTPRF-215ENST00000496447 5887 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PTPRF-203ENST00000372407 4600 ntTSL 211.74□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 FARP1-232ENST00000601009 667 ntTSL 59.16□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ALDOA-223ENST00000567555 554 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-202ENST00000368256 1063 ntTSL 310.18□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 38.44□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 27.23□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 55.97□□□□□ -1.451e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 34.95□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 33.34□□□□□ -1.871e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.845e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 AP3D1-212ENST00000592488 707 ntTSL 316.9■□□□□ 0.37e-9■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 SMYD2-206ENST00000491455 3809 ntTSL 213.52□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GTPBP4-205ENST00000491635 2220 ntTSL 29.91□□□□□ -0.823e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-14■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-14■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-14■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 58.25□□□□□ -1.091e-7■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 214.11□□□□□ -0.154e-8■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-8■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 512.31□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.914e-8■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 SLC6A6-201ENST00000452151 284 ntTSL 56.72□□□□□ -1.335e-10■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 55.69□□□□□ -1.53e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.81e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 36.93□□□□□ -1.31e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.23□□□□□ -1.411e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.89□□□□□ -1.631e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 24.67□□□□□ -1.661e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.64□□□□□ -1.831e-35■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.053e-6■■■■□ 22.6
RBM22Q9NW64 TMEM214-211ENST00000475258 927 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-14■■■■□ 22.5
RBM22Q9NW64 AGFG2-202ENST00000429987 928 ntTSL 317.9■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 22.5
RBM22Q9NW64 PICALM-216ENST00000531771 631 ntTSL 33.4□□□□□ -1.872e-6■■■■□ 22.5
RBM22Q9NW64 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 22.5
RBM22Q9NW64 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.675e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 24.19□□□□□ -1.747e-7■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.374e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-12■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-12■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-12■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 MCL1-203ENST00000464132 1099 ntTSL 29.47□□□□□ -0.893e-12■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 DMTF1-211ENST00000430405 637 ntTSL 55.11□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 DMTF1-209ENST00000425705 980 ntTSL 1 (best)2.86□□□□□ -1.951e-6■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 DEK-208ENST00000515770 730 ntTSL 55.34□□□□□ -1.553e-10■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 DEK-206ENST00000512145 791 ntTSL 54.6□□□□□ -1.673e-10■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 22.4
RBM22Q9NW64 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.844e-8■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-8■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 22.3
RBM22Q9NW64 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 22.3
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