Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGTLC3B5MD39 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms