Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF613Q6PF04 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms