RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361092.8

NMRK1-201, Transcript of nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMRK1, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1-201ENST00000361092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.65■■■■■ 5.54
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NMRK1-201ENST00000361092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.07■■■■■ 4.33
NMRK1-201ENST00000361092 NACADO15069 1562 aa41.91■■■■■ 4.3
NMRK1-201ENST00000361092 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.54■■■■■ 4.24
NMRK1-201ENST00000361092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.53■■■■■ 4.24
NMRK1-201ENST00000361092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
NMRK1-201ENST00000361092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.13■■■■■ 4.17
NMRK1-201ENST00000361092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.11■■■■■ 4.17
NMRK1-201ENST00000361092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
NMRK1-201ENST00000361092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
NMRK1-201ENST00000361092 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.86■■■■■ 4.13
NMRK1-201ENST00000361092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.43■■■■■ 4.06
NMRK1-201ENST00000361092 SCRIBQ14160 1630 aa40.39■■■■■ 4.06
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NMRK1-201ENST00000361092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.76■■■■□ 3.96
NMRK1-201ENST00000361092 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
NMRK1-201ENST00000361092 NCAPD3P42695 1498 aa38.7■■■■□ 3.79
NMRK1-201ENST00000361092 SMARCA4P51532 1647 aa38.64■■■■□ 3.78
NMRK1-201ENST00000361092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.6■■■■□ 3.77
NMRK1-201ENST00000361092 SMARCA2P51531 1590 aa38.52■■■■□ 3.76
NMRK1-201ENST00000361092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
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NMRK1-201ENST00000361092 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.35■■■■□ 3.73
NMRK1-201ENST00000361092 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.23■■■■□ 3.71
NMRK1-201ENST00000361092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
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NMRK1-201ENST00000361092 NESP48681 1621 aa37.87■■■■□ 3.65
NMRK1-201ENST00000361092 CUX2O14529 1486 aa37.81■■■■□ 3.64
NMRK1-201ENST00000361092 WIZO95785 1651 aa37.76■■■■□ 3.64
NMRK1-201ENST00000361092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.74■■■■□ 3.63
NMRK1-201ENST00000361092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
NMRK1-201ENST00000361092 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.5■■■■□ 3.59
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NMRK1-201ENST00000361092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.48■■■■□ 3.59
NMRK1-201ENST00000361092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.41■■■■□ 3.58
NMRK1-201ENST00000361092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
NMRK1-201ENST00000361092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.33■■■■□ 3.57
NMRK1-201ENST00000361092 CFTRP13569 1480 aa37.18■■■■□ 3.54
NMRK1-201ENST00000361092 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.13■■■■□ 3.54
NMRK1-201ENST00000361092 WDR62O43379 1518 aa37.07■■■■□ 3.53
NMRK1-201ENST00000361092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.05■■■■□ 3.52
NMRK1-201ENST00000361092 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.05■■■■□ 3.52
NMRK1-201ENST00000361092 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.91■■■■□ 3.5
NMRK1-201ENST00000361092 PRDM2Q13029 1718 aa36.82■■■■□ 3.49
NMRK1-201ENST00000361092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
NMRK1-201ENST00000361092 TOPBP1Q92547 1522 aa36.4■■■■□ 3.42
NMRK1-201ENST00000361092 ABCC8Q09428 1581 aa36.39■■■■□ 3.42
NMRK1-201ENST00000361092 IFT140Q96RY7 1462 aa36.32■■■■□ 3.41
NMRK1-201ENST00000361092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.31■■■■□ 3.4
NMRK1-201ENST00000361092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
NMRK1-201ENST00000361092 OSCARQ8IYS5 282 aa36.08■■■■□ 3.37
NMRK1-201ENST00000361092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
NMRK1-201ENST00000361092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
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NMRK1-201ENST00000361092 CUX1P39880 1505 aa35.91■■■■□ 3.34
NMRK1-201ENST00000361092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
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NMRK1-201ENST00000361092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.86■■■■□ 3.33
NMRK1-201ENST00000361092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.86■■■■□ 3.33
NMRK1-201ENST00000361092 WDR97A6NE52 1622 aa35.79■■■■□ 3.32
NMRK1-201ENST00000361092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
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NMRK1-201ENST00000361092 CHD1O14646 1710 aa35.66■■■■□ 3.3
NMRK1-201ENST00000361092 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.58■■■■□ 3.29
NMRK1-201ENST00000361092 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.58■■■■□ 3.29
NMRK1-201ENST00000361092 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.58■■■■□ 3.29
NMRK1-201ENST00000361092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.55■■■■□ 3.28
NMRK1-201ENST00000361092 GRIN2BQ13224 1484 aa35.54■■■■□ 3.28
NMRK1-201ENST00000361092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
NMRK1-201ENST00000361092 ARHGEF11O15085 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
NMRK1-201ENST00000361092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.52■■■■□ 3.28
NMRK1-201ENST00000361092 FBLN2P98095 1184 aa35.48■■■■□ 3.27
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NMRK1-201ENST00000361092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.46■■■■□ 3.27
NMRK1-201ENST00000361092 TOP2BQ02880 1626 aa35.45■■■■□ 3.27
NMRK1-201ENST00000361092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.43■■■■□ 3.26
NMRK1-201ENST00000361092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
NMRK1-201ENST00000361092 PBRM1Q86U86 1689 aa35.4■■■■□ 3.26
NMRK1-201ENST00000361092 SYNJ2O15056 1496 aa35.39■■■■□ 3.26
NMRK1-201ENST00000361092 SYNJ1O43426 1573 aa35.38■■■■□ 3.25
NMRK1-201ENST00000361092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
NMRK1-201ENST00000361092 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.33■■■■□ 3.25
NMRK1-201ENST00000361092 ARAP1Q96P48 1450 aa35.21■■■■□ 3.23
NMRK1-201ENST00000361092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.16■■■■□ 3.22
NMRK1-201ENST00000361092 ADAMTS12P58397 1594 aa35.13■■■■□ 3.21
NMRK1-201ENST00000361092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.09■■■■□ 3.21
NMRK1-201ENST00000361092 GRIN2AQ12879 1464 aa35.09■■■■□ 3.21
NMRK1-201ENST00000361092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.04■■■■□ 3.2
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NMRK1-201ENST00000361092 CEP170Q5SW79 1584 aa34.93■■■■□ 3.18
NMRK1-201ENST00000361092 SHROOM2Q13796 1616 aa34.81■■■■□ 3.16
NMRK1-201ENST00000361092 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.74■■■■□ 3.15
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NMRK1-201ENST00000361092 IGF1RP08069 1367 aa34.7■■■■□ 3.15
NMRK1-201ENST00000361092 CUL7Q14999 1698 aa34.63■■■■□ 3.13
NMRK1-201ENST00000361092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.62■■■■□ 3.13
NMRK1-201ENST00000361092 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
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