Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAL1Q4LDG9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms