Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 CFL1-209ENST00000530413 647 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.589e-13■□□□□ 9.9
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G3BP1Q13283 GPI-215ENST00000591204 559 ntTSL 411.17□□□□□ -0.622e-12■□□□□ 9.9
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G3BP1Q13283 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.674e-6■□□□□ 9.9
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G3BP1Q13283 ACSS2-208ENST00000473172 665 ntTSL 324.36■■□□□ 1.494e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.474e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.154e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.854e-6■□□□□ 9.9
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G3BP1Q13283 NME2-203ENST00000485076 554 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 9.8
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G3BP1Q13283 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.422e-10■□□□□ 9.8
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G3BP1Q13283 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.834e-8■□□□□ 9.8
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G3BP1Q13283 ARID1B-229ENST00000637741 3915 ntTSL 59.65□□□□□ -0.864e-8■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ARID1B-215ENST00000636254 3848 ntTSL 59.49□□□□□ -0.894e-8■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ARID1B-234ENST00000637933 5043 nt9.41□□□□□ -0.94e-8■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 EIF5A-210ENST00000575001 609 ntTSL 228.84■■■□□ 2.218e-10■□□□□ 9.8
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G3BP1Q13283 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.391e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.641e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.921e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 DDX54-208ENST00000551344 872 ntTSL 523.53■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 RAVER1-202ENST00000585935 470 ntTSL 322.34■■□□□ 1.171e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.131e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 GALE-207ENST00000459934 1563 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 AKAP1-213ENST00000574683 588 ntTSL 219.72■□□□□ 0.752e-15■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ECI2-210ENST00000495548 814 ntTSL 517.35■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 DDX54-210ENST00000552375 780 ntTSL 517.27■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ECI2-209ENST00000489086 558 ntTSL 217.03■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 RAVER1-205ENST00000593136 500 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.8
G3BP1Q13283 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 516.06■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 9.8
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