Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 523.79■■□□□ 1.49e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.169e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 320.15■□□□□ 0.829e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.799e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SEPT5-214ENST00000480423 563 ntTSL 427.51■■□□□ 1.993e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 310.59□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)25.08■■□□□ 1.618e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 510.08□□□□□ -0.88e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.745e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STT3A-215ENST00000531599 973 ntTSL 312.56□□□□□ -0.47e-13■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 29.81□□□□□ -0.847e-13■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STT3A-208ENST00000526726 582 ntTSL 36.91□□□□□ -1.37e-13■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)35.68■■■■□ 3.36e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)35.68■■■■□ 3.36e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.226e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.156e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)28.29■■■□□ 2.126e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 527.78■■■□□ 2.046e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 16e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 420.21■□□□□ 0.836e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SORBS3-210ENST00000520574 699 ntTSL 335.96■■■■□ 3.352e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 333.3■■■□□ 2.922e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 430.09■■■□□ 2.412e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.68■■■□□ 2.184e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.412e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.164e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 58.29□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.843e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.953e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.643e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.512e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.42e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-209ENST00000592159 411 ntTSL 314.61□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.689e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 225.03■■□□□ 1.65e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-209ENST00000506530 5371 ntTSL 223.25■■□□□ 1.315e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.992e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 425.33■■□□□ 1.652e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 321.8■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.756e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 421.61■■□□□ 1.057e-7■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.429e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 CHPF2-202ENST00000465601 782 ntTSL 318.9■□□□□ 0.624e-15■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 228.29■■■□□ 2.123e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.014e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.964e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 229.2■■■□□ 2.261e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)27.89■■■□□ 2.061e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.593e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 224.93■■□□□ 1.584e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.534e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.454e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.134e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.034e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-8■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.312e-10■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)34.44■■■■□ 3.13e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.923e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 224.32■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-6■■■□□ 14.7
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.761e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.181e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.971e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.551e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.431e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.391e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-203ENST00000349299 596 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-30■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 421.92■■□□□ 1.19e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 233.74■■■□□ 2.994e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.993e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.863e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.733e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.493e-6■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 DTNBP1-211ENST00000515875 1306 ntTSL 540.5■■■■■ 4.073e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.023e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.863e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 DTNBP1-208ENST00000511762 843 ntTSL 339.01■■■■□ 3.843e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.533e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 DTNBP1-209ENST00000513680 1518 ntTSL 536.2■■■■□ 3.393e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 HMG20B-214ENST00000493191 852 ntTSL 335.63■■■■□ 3.293e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 MED25-203ENST00000593595 506 ntTSL 235.17■■■■□ 3.223e-7■■■□□ 14.6
DROSHAQ9NRR4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.23e-7■■■□□ 14.6
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