Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms