Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BNH8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BNH8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BNH8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BNH8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BNH8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BNH8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H3BNH8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
H3BNH8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H3BNH8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BNH8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms