Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM2Q9BVW6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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