Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MAD1L1Q9Y6D9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAD1L1Q9Y6D9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAD1L1Q9Y6D9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MAD1L1Q9Y6D9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAD1L1Q9Y6D9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms