Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1DQ9Y2S0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1DQ9Y2S0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR1DQ9Y2S0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms