Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HECTD1Q9ULT8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HECTD1Q9ULT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms