Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT4Q9P109 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GCNT4Q9P109 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCNT4Q9P109 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNT4Q9P109 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GCNT4Q9P109 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCNT4Q9P109 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms