Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX56Q9NY93 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX56Q9NY93 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX56Q9NY93 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX56Q9NY93 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX56Q9NY93 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX56Q9NY93 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX56Q9NY93 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX56Q9NY93 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX56Q9NY93 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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