Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIN1Q9NXP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GIN1Q9NXP7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIN1Q9NXP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms