Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLE3Q9NRF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLE3Q9NRF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE3Q9NRF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms