Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GDF3Q9NR23 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDF3Q9NR23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF3Q9NR23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GDF3Q9NR23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms