Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRCC1Q9NPI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRCC1Q9NPI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRCC1Q9NPI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms