Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UPF3BQ9BZI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UPF3BQ9BZI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UPF3BQ9BZI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
UPF3BQ9BZI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms