Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QTNF6Q9BXI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF6Q9BXI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF6Q9BXI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF6Q9BXI9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF6Q9BXI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms