Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YIPF2Q9BWQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF2Q9BWQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF2Q9BWQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF2Q9BWQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms