Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP85Q9BW27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP85Q9BW27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP85Q9BW27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP85Q9BW27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms