Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf50Q9BV19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf50Q9BV19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf50Q9BV19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf50Q9BV19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms