Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM79Q9BSE2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM79Q9BSE2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.4 ms