Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNT1Q96Q11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNT1Q96Q11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNT1Q96Q11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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