Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9orf72Q96LT7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf72Q96LT7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf72Q96LT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms