Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLAMF9Q96A28 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLAMF9Q96A28 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLAMF9Q96A28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms