Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC38A4Q969I6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A4Q969I6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms