Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATRIPQ8WXE1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRIPQ8WXE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRIPQ8WXE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms