Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP2Q8NFZ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP2Q8NFZ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP2Q8NFZ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms