Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY8

PPHLN1, Periphilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPHLN1Q8NEY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPHLN1Q8NEY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPHLN1Q8NEY8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPHLN1Q8NEY8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPHLN1Q8NEY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPHLN1Q8NEY8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms